Лесные сообщества
В тайге в Вологодской области главными породами деревьев являются ель и сосна, только на востоке области заметна примесь пихты и лиственницы. Распространены березы, осина, ольха серая, различные виды ив, рябина, черемуха. Довольно разнообразны кустарники, кустарнички и травы. Южнее под пологом хвойных деревьев появляются липа, вяз и клен. И в травянистом ярусе заметно присутствие проникших из зоны широколиственных лесов сныти, ландыша, марьянника дубравного, медуницы, копытня, бора развесистого и других трав. Под полог ельников обычно проникает мало света, поэтому подлесок в них редок, но широко распространены кустарнички и травы, а почва покрыта мхами и подстилкой из опавшей хвои. В подлеске таких лесов растут жимолость, крушина и рябина, в травяно-кустарничковом ярусе — черника, брусника, линнея северная, кислица, грушанка и разные папоротники. В переувлажненных, заболоченных местах растут ельники-долгомошники с кукушкиным льном и сфагновые ельники, в которых кроме сфагнума растут лесные и болотные травы и кустарнички. В южных районах иногда встречаются ельники сложные, где кроме ели, березы и осины, растут липа, клен, дуб, а среди кустарников господствуют жимолость Палласа, волчье лыко, калина обыкновенная. Травянистый покров в сложных ельниках разнообразен, а моховой развит слабо.
На бедных сухих песчаных грунтах растут сосняки лишайниковые — светлые высокоствольные боры-беломошники. В благоприятные годы они дают большой урожай белых грибов, лисичек, маслят, рыжиков. Подлесок в таких лесах состоит из рябины, крушины ломкой и можжевельника. В составе трав изредка встречаются зимолюбка зонтичная, толокнянка и одноцветка одноцветковая. Почва в них покрыта сплошным ковром из кукушкина льна, а в кустарничковом ярусе - черника.
Сообщества лугов
На возвышенных участках располагаются суходольные луга. На них растут низкорослые травы — мятлик, душистый колосок, зверобой, манжетка, трясунка средняя и тмин обыкновенный, дающие небольшие урожаи. Но при повышенном увлажнении почв и суходольные луга дают большие урожаи разнообразных трав. Низинные луга из злаков, разнотравья и осок развиваются в условиях избыточного увлажнения. На них преобладают щучка дернистая, лисохвост луговой, щавель кислый, горец змеиный, лабазник вязолистный, гравилат речной и купальница европейская. Травы на таких лугах дают лучшие урожаи по сравнению с суходолами. В долинах рек располагаются пойменные луга. Остающийся после половодья ил становится хорошим удобрением, поэтому эти луга — ценные сенокосные угодья. На них растут высокие злаки — овсяница луговая и тимофеевка, бобовые — горошек мышиный, чина луговая и клевера, разнотравье — василистник, герань луговая и горец змеиный. На лугах исключительно разнообразны насекомые.
Сообщества болот
На верховых болотах сплошной покров образует мох сфагнум, а в травяно-кустарничковом покрове преобладают подбел, Кассандра, багульник, морошка, клюква болотная.
Сообщества водоемов
У кромки воды и на самых малых глубинах растут так называемые земноводные растения — осоки, тростник, хвощ речной, плавающий на поверхности водоёма ковёр водных и болотных растений, состоящий из камыша, рогоза, вахты, других корневищных растений и зелёных мхов. Дальше от берега «уходят» кувшинки, кубышки, горец земноводный — растения с плавающими листьями, и полностью погруженные в воду рдесты, уруть и водяная сосенка, цветы которых поднимаются над водой.